|
|
|
содержание .. 23 24 25 26 ..
НЕПАРАМЕТРИЧЕСКИЕ КРИТЕРИИ
369
et al. Atrial natriuretic factor: reduced cardiac content in cirrhotic
rats with ascites. Am. J. Physiol., 250:F749—F752, 1986) исследо-
вали его роль в задержке натрия и воды при циррозе печени.
Крысам вводили экстракт предсердия: одной группе — экст-
ракт, полученный от здоровых крыс, другой — от крыс с цирро-
зом печени. Регистрировали изменение выделения натрия с мо-
чой (в процентах от исходного). Результаты представлены в таб-
лице. Какой вывод можно сделать по результатам опыта?
Экстракт от здоровых крыс Экстракт от крыс с циррозом
760
80
1000
80
1370
80
1680
210
1970
210
2420
320
3260
500
5000
610
5400
760
7370
760
890
890
1870
1950
10.7. Введя изотоп внутривенно и наблюдая за его распростра-
нением с помощью гамма-камеры, можно определить кровена-
полнение различных органов, в том числе легких. Р. Окада и со-
авт. (R. Okada et al. Radionuclide-determined change in pulmonary
blood volume with exercise: improved sensitivity ofmultigated blood-
pool scanning in detecting coronary-artery disease. N. Engl. J. Med.,
301:569—576, 1979) решили использовать этот метод для локали-
зации поражения коронарных артерий при ишемической болез-
ни сердца. Правая коронарная артерия снабжает кровью главным
образом правый желудочек, левая — главным образом левый. Ле-
вый желудочек перекачивает кровь, которая поступает в него из
легких, по всему телу. При поражении левой коронарной артерии
кровоснабжение левого желудочка ухудшается. В покое, когда
370
ГЛАВА 10
объем перекачиваемой крови невелик, это никак не проявляет-
ся, однако при физической нагрузке это приводит к накопле-
нию крови в легких. При поражении правой коронарной арте-
рии этого не происходит. Примерно так рассуждали авторы,
приступая к работе. Было обследовано 33 человека: 9 здоровых
(1-я группа) и 24 больных ишемической болезнью сердца, из
них 5 с поражением только правой коронарной артерии (2-я груп-
па) и 19 с поражением обеих коронарных артерий или только
левой (3-я группа). Рассчитывали отношение кровенаполнения
легких при физической нагрузке к кровенаполнению в покое:
по мысли авторов, в 3-й группе этот показатель должен быть
выше, чем в первых двух. Результаты представлены в таблице.
Группа
1
2
3
0,83
0,86
0,98
0,89
0,92
1,02
0,91
1,00
1,03
0,93
1,02
1,04
0,94
1,20
1,05
0,97
1,06
0,97
1,07
0,98
1,22
1,02
1,07
1,23
1,13
1,08
1,32
1,10
1,15
1,37
1,18
1,12
1,58
Различаются ли группы межцу собой? Если да, то как имен-
но и достаточно ли велико различие, чтобы исследуемый показа-
НЕПАРАМЕТРИЧЕСКИЕ КРИТЕРИИ
371
тель можно было использовать для определения пораженной ко-
ронарной артерии?
10.8. Грезя о славе, автор этих строк предложил новый метод
оценки эффективности лечения. Преимущество метода — его
простота. Он состоит в следующем. Если у больного интересую-
щий нас показатель увеличивается, ставится оценка +1, если
уменьшается — 0 (допустим, случай неизменности показателя
исключен). Сумма оценок по всем больным и есть значение кри-
терия G. Вот пример расчета.
Значение показателя
до
после
Изменение
Больной лечения
лечения показателя
Оценка
1
100
110
+10
+1
2
95
96
+1
+1
3
120
100
-20
0
4
111
123
+12
+1
Значение критерия G = 1 + 1 + 0 + 1 = 3. Является ли G полно-
ценным критерием? Постройте распределение G и найдите кри-
тическое значение для случаев, когда число больных равно 4 и 6.
Глава 11
Анализ выживаемости
До сих пор мы имели дело только с полными данными: мы зна-
ли исход лечения у каждого больного. В гл. 5 мы разобрали ра-
боту, целью которой было определить влияние аспирина на риск
тромбоза шунта у больных на гемодиализе. Мы подсчитали
число больных с тромбозом и без тромбоза в группах аспирина
и плацебо и свели результаты в таблицу сопряженности (см. табл.
5.1). Затем мы построили вторую таблицу сопряженности, со-
державшую ожидаемые числа, которые наблюдались бы, если
бы в группах аспирина и плацебо частота тромбозов была оди-
наковой. По двум этим таблицам мы вычислили величину χ2.
Полученное значение оказалось достаточно большим, чтобы
отклонить гипотезу об отсутствии межгрупповых различий. В
этом исследовании срок наблюдения всех больных был одина-
ковым и никто из них не выбыл из-под наблюдения до заверше-
ния исследования. То же самое можно сказать об исследовании
галотановой и морфиновой анестезии, с которым мы впервые
встретились в гл. 2. Тогда, говоря о трудностях, связанных с
проспективными исследованиями, мы упомянули о проблеме
АНАЛИЗ ВЫЖИВАЕМОСТИ
373
выбывания*, но в рассмотренных примерах мы с ней не сталки-
вались. Однако ситуация, когда исследование должно быть за-
вершено до наступления исхода у всех больных, для проспек-
тивных исследований, в частности клинических испытаний,
скорее правило, чем исключение. Понятно, что на этот случай
нужны специальные статистические методы.
Наиболее типичный пример исследования такого рода — это
изучение выживаемости, когда больных наблюдают от начала
болезни до смерти. Обычно больных включают в исследование
на всем его протяжении, поэтому оно всегда заканчивается до
смерти последнего больного. Истинная продолжительность бо-
лезни выживших к концу исследования остается неизвестной.
Кроме того, исследователь может потерять больного из виду до
завершения исследования, если тот, к примеру, переехал в дру-
гой город. Наконец, больной может умереть по причине, не свя-
занной с изучаемым заболеванием, например погибнуть вавто-
катастрофе. Во всех этих случаях длительность заболевания
остается неизвестной, мы знаем только, что она превышает не-
который срок.
Сейчас мы займемся именно изучением выживаемости, од-
нако будем иметь в виду, что те методы, которые мы освоим,
пригодны и для других исследований, в том числе для контроли-
руемых испытаний.
ПАССИВНОЕ КУРЕНИЕ НА ПЛУТОНЕ
Табачные дельцы, теснимые все дальше от Земли борцами за здо-
ровый образ жизни, окопались на Плутоне. Они решили превра-
тить эту девственную планету в оплот табакокурения. Многое
наивные плутониане поддались навязчивой рекламе и закурили.
Но это еще полбеды. Как известно, на Плутоне очень холодно,
* Здесь мы не говорим о пропусках в данных, причины которых — ошибка
измерения, разбитая пробирка с пробой, потерянный анализ и т. п. К дан-
ным, содержащим пропуски, применяются обычные статистические ме-
тоды с внесением необходимых вычислительных поправок. Подробнее об
анализе данных с пропусками можно прочесть в книге S. Glantz, В. Slinker.
Primer of applied regression and analysis of variance. McGraw-Hill, N.Y., 1990.
374
ГЛАВА 11
поэтому его обитатели редко покидают свои домики. Чрезвы-
чайно деликатные по природе, плутониане не могут выставить
курильщика на улицу и вынуждены дышать табачным дымом,
который производит их несознательный соотечественник.
Плутониане вообще живут недолго, что же будет теперь, ко-
гда Плутон охватила эпидемия пассивного курения! Первое, что
мы должны сделать в этой ситуации, — это оценить продолжи-
тельность жизни плутонианина после начала пассивного куре-
ния.
Вот как проводилось исследование. Мы попросили всех плу-
тониан сообщать нам, как только в их домике появится актив-
ный курильщик. Выявленных таким образом пассивных куриль-
щиков включали в группу наблюдения и дожидались (увы!) их
смерти. Исследование длилось 15 плутонианских часов; за это
время пассивными курильщиками стали 10 плутониан. Первы-
ми сообщили о начале пассивного курения А и Б. Остальные
участники вошли в группу наблюдения уже после начала ис-
следования (что типично для исследований выживаемости); их
звали В, Г, Д, Е, Ж, 3, И и К. Периоды наблюдения за каждым из
них показаны на рис 11.1А в виде горизонтальных отрезков. Из
десяти участников к концу исследования умерли семь — А, Б,
В, Е, Ж, 3 и К; в живых остались двое — Г и И. Еще одного
участника, Д, местное начальство на 14-м часу исследования
послало в командировку на Нептун; что с ним было дальше,
нам неизвестно.
Таким образом, продолжительность жизни после начала пас-
сивного курения нам известна в 7 случаях. В 3 случаях нам из-
вестно только, что наблюдаемые прожили не меньше такого-то
срока*. Неважно, почему они не прослежены до конца жизни —
* В исследованиях выживаемости неполные данные называют также цен-
зурированными. Данные о трех выбывших плутонианах цензурированы
справа — известен момент начала наблюдения, но неизвестно, когда на-
блюдаемый умер. Если бы в исследовании участвовали плутониане, на-
чавшие курить до его начала, то мы могли бы получить также данные,
цензурированные слева, а также цензурированные с обеих сторон. Эта
виды цензурирования и соответствующие методы анализа можно найти в
D. Collett. Modelling survival in medical research. Chapman and Hall, London,
1994 и Е. Т. Lee. Statistical methods for survival data analysis. Wiley, 2nd ed..
New York, 1992.
АНАЛИЗ ВЫЖИВАЕМОСТИ
375
Рис. 11.1. Продолжительность жизни плутониан после начала пассивного ку-
рения. А. Ход исследования показан в обычной шкале времени. Жизнь плуто-
нианина после начала пассивного курения представлена горизонтальным от-
резком. Левый конец отрезка—это начало наблюдения. На правом конце от-
резка — черный или белый кружок. Черный кружок означает, что плутонианин
умер и, таким образом, продолжительность его жизни нам известна. Белый
кружок означает, что исследование закончилось до его смерти либо он куда-то
уехал — словом, выбыл из-под наблюдения. Относительно выбывших нам из-
вестно только, что они прожили не меньше определенного срока. Б. Ход ис-
следования показан так, как будто все плутониане начали наблюдаться одно-
временно. Теперь на шкале времени не астрономические часы, а часы наблю-
дения. Такое представление данных облегчит нам дальнейшие расчеты.
376
ГЛАВА 11
прекратилось ли исследование, уехали они куда-то, — всех их
мы будем называть выбывшими.
На рис. 11.1 Б изображены те же данные, что и на рис. 11.1А.
Теперь отрезки, соответствующие периоду наблюдения за каж-
дым плутонианином, расположены так, как если бы все наблю-
дения были начаты в один момент. Это представление данных
более удобно. Теперь сразу видно, кто сколько прожил после
начала пассивного курения. Кружок на правом конце каждого
из отрезков показывает, умер плутонианин за время наблюде-
ния (кружок закрашен) или выбыл (кружок не закрашен).
Если бы продолжительность наблюдения была одинаковой, мы
могли бы рассчитать долю выживших и применить методы, опи-
санные в гл. 5. Однако поскольку участники входили в группу
наблюдения на разных сроках исследования, это условие не вы-
полняется. Если бы все наблюдаемые умерли, то можно было бы
применить методы, изложенные в гл. 2 или 10. Однако и этого не
произошло, как это обычно и бывает в исследованиях такого рода.
Для анализа выживаемости нужны новые методы. Прежде чем с
ними познакомиться, сформулируем требования, которым долж-
ны удовлетворять все исследования выживаемости.
• Для всех наблюдаемых известно время начала наблюдения.
• Для всех наблюдаемых известно время окончания наблюде-
ния, а также — умер он или выбыл.
• Выбор наблюдаемых произведен случайно.
Для начала мы научимся строить кривую выживаемости, а
затем перейдем к оценке статистической значимости различий
кривых выживаемости.
КРИВАЯ ВЫЖИВАЕМОСТИ
Кривая выживаемости задает вероятность пережить любой из
моментов времени после некоторого начального события. Эту
вероятность обычно называют просто выживаемостью. В при-
мере, который мы сейчас разбираем, кривая выживаемости при-
меняется для изучения продолжительности жизни. Однако кри-
выми такого рода можно описать продолжительность самых раз-
нообразных процессов. Тогда в качестве исхода будет выступать
АНАЛИЗ ВЫЖИВАЕМОСТИ
377
Рис. 11.2. Типичная кривая выживаемости. В начале значение функции выживаемости
S(t), естественно, равно 1. В дальнейшем оно уменьшается, постепенно приближаясь к
нулю. Время, за которое значение функции выживаемости достигает значения 0,5, на-
зывается медианой выживаемости.
не смерть, а другое интересующее нас событие, не всегда неже-
лательное. Например, можно изучать срок лечения какого-либо
заболевания (исход — ремиссия), длительность лечения беспло-
дия или эффективность контрацепции (исход в обоих случаях
— наступление беременности), долговечность протеза (исход-
поломка).
Для начала, как всегда, рассмотрим кривую выживаемости
для совокупности. Такая кривая получилась бы, если бы мы про-
следили судьбу всех плутониан от рождения до смерти. Выжи-
ваемость к моменту времени t обозначим S(t), Дадим определе-
ние.
Выживаемость S(t) — это вероятность прожить более t с
момента начала наблюдения.
Для совокупности эта вероятность выражается формулой:
Число переживших момент
t
S
(t)
=
Объем совокупности
Типичная кривая выживаемости изображена на рис. 11.2. По-
нятно, что в точке 0, соответствующей начальному моменту, на-
пример моменту рождения, выживаемость равна 1. Затем кривая
378
ГЛАВА 11
постепенно понижается и, начиная с некоторой точки, стано-
вится равной 0. Возраст, до которого доживает ровно половина
совокупности, называется медианой выживаемости.
Наша цель состоит в том, чтобы оценить выживаемость по
выборке. Никакого другого способа ее оценки не существует.
Если бы не выбывшие, это было бы очень просто:
Число переживших момент
t
S
(t)
=
Объем совокупности
В тех случаях, когда имеет место выбывание (а это бывает
почти всегда), мы не сможем воспользоваться этой формулой.
Вместо этого поступим следующим образом. Для каждого мо-
мента времени, когда произошла хотя бы одна смерть, оценим
вероятность пережить этот момент. Такой оценкой будет отно-
шение числа переживших этот момент к числу наблюдавшихся
к этому моменту. Тогда, согласно правилу умножения вероятно-
стей, вероятность пережить некоторый момент времени для ка-
ждого вступившего в исследование будет равна произведению
этих оценок от нулевого до данного момента. Рассмотрим эту
процедуру более подробно на примере плутонианских пассив-
ных курильщиков.
Будем считать, что все начали наблюдаться в момент времени
t = 0, и от этого момента будем отсчитывать все сроки (рис. 11.1Б).
Расположим плутониан по возрастанию длительности наблюде-
ния (табл. 11.1) и укажем саму эту длительность во второй колон-
ке таблицы. Длительность наблюдения выбывших плутониан
пометим знаком «+» — это будет означать, что плутонианин про-
жил более такого-то срока, а на сколько — неизвестно. Первый
плутонианин (К) умер через 2 часа, второй (З) — через 6 часов
после начала наблюдения. На 7-м часу умерли двое — А и В, на
этом же сроке выбыл из-под наблюдения плутонианин И.
Первый плутонианин умер в 2 часа. Наблюдались в это вре-
мя все 10 плутониан. Значит, вероятность умереть в 2 часа —
d2/n2 = 1/10 = 0,1. Соответственно, вероятность не умереть в 2
часа для тех, кто дожил до этого времени:
d
1
9
2
f
=
1−
=
1−
=
=
0,900
2
n
10
10
2
АНАЛИЗ ВЫЖИВАЕМОСТИ
379
Таблица 11.1. Результаты исследования продолжительности
жизни плутониан после начала пассивного курения.
Наблюдалось
Умерло
Время
к моменту t
в момент t
Плутонианин
t
nt
dt
К
2
10
1
З
6
9
1
А и В
7
8
2
И
7+
-
Е
8
5
1
Ж
9
4
1
Д
11+
Б
12
2
1
Г
12+
-
Следующий плутонианин умер в 6 часов. Наблюдалось к это-
му времени 9 плутониан. Для доживших до 6 часов вероятность
умереть в 6 часов — d6/n6 = 1/9 = 0,111, а вероятность не уме-
реть в 6 часов
d
1
8
6
f
=
1−
=
1−
=
=
0,889
6
n
6
9
9
Теперь мы можем оценить вероятность, что плутонианин про-
живет более 6 часов, то есть
S
(6). Прожить более 6 часов — это
значит не умереть в 2 часа и не умереть в 6 часов. То есть, по
правилу умножения вероятностей,
S
(
6
)
= f
× f
=
0,900
× ,889
=
0,800
2
6
Уже рискуя надоесть читателю однообразными рассуждения-
ми, перейдем к следующему печальному событию. В 7 часов
умерло сразу 2 плутонианина, наблюдалось к этому времени 8.
Имеем
d
2
6
7
f
=
1−
=
1−
=
=
0,750,
7
n
7
8
8
S
(7)
= f
× f
× f
=
0,900
× ,889
× ,750
=
0,600
2
6
7
380
ГЛАВА 11
Внимательному читателю может показаться, что мы зря ус-
ложняем дело. Действительно, приведя сложные выкладки, мы
получили то, что и так было очевидно: если через 7 часов умер-
ло четверо из десяти плутониан, то дольше 7 часов прожило
шестеро и выживаемость составляет
(7)
S
= 6/10 = 0,600.
Еще терпение! До сих пор у нас не было выбывших, поэто-
му результаты и совпадают. Посмотрим, что будет в 8 часов. В 8
часов умирает плутонианин Е. Наблюдаются к этому времени 5
плутониан (4 умерли, 1 выбыл: 10 - 4 - 1 = 5).
d
1
4
8
f
=
1−
=
1−
=
=
0,800,
8
n
5
5
8
S(8)
= f
× f
× f
× f
= ,900
× ,889
× ,750
× ,750
= ,480
2
6
7
8
Если бы мы считали «долю выживших» старым способом,
мы бы получили для
(8)
S
оценку 0,5. В дальнейшем, чем боль-
ше будет выбывших, тем больше будет и расхождение.
Описанная процедура называется расчетом выживаемости
моментным методом, или методом Каплана—Мейера.
Математическое выражение моментного метода:
d
t
S
(t)
=Π
1−
,
n
t
где dt — число умерших в момент t, nt — число наблюдав-
шихся к моменту t, П (большая греческая буква «пи») —
символ произведения. В данном случае она означает, что
надо перемножить значения (1 - dt/nt) для всех моментов,
когда произошла хотя бы одна смерть. В принципе, мож-
но перемножать и по остальным моментам, однако, если
dt = 0, то (1 - dt/nt) = 1, а умножение на единицу на ре-
зультате никак не скажется.
В табл. 11.2 расчет выживаемости моментным методом
приведен полностью. Теперь мы можем представить ре-
зультаты исследования выживаемости плутониан после
начала пассивного курения в виде графика (рис. 11.3). Точ-
ки на графике соответствуют моментам, когда умер хотя
бы один из наблюдавшихся. Эти точки обычно соединяют
ступенчатой линией. В момент времени 0 выживаемость со-
АНАЛИЗ ВЫЖИВАЕМОСТИ
381
Таблица 11.2. Расчет кривой выживаемости плутониан после
начала пассивного курения.
Наблю-
Доля пере-
Плутони-
далось к Умерло в живших Выжи-
анин
Время моменту t момент t момент t ваемость
d
t
t
nt
dt
f
t
=
1−
S
(t)
n
t
К
2
10
1
0,900
0,900
З
6
9
1
0,899
0,800
А и В
7
8
2
0,750
0,600
И
7+
-
-
Е
8
5
1
0,800
0,480
Ж
9
4
1
0,750
0,360
Д
11+
-
-
Б
12
2
1
0,500
0,180
Г
12+
-
-
ставляет 1,0, затем постепенно снижается. В данном случае умер-
ли не все наблюдавшиеся — поэтому нуля линия не достигает.
Медиана выживаемости
Наиболее полная характеристика выживаемости — это кривая
выживаемости, которую мы только что построили. Хотелось бы,
однако, иметь и обобщенный показатель, характеризующий вы-
живаемость в виде одного числа. Распределение по продолжи-
тельности жизни, как правило, асимметрично, поэтому лучше
всего тут подходит медиана. Определение медианы выживаемо-
сти для совокупности мы дали выше. Для выборки медиана вы-
живаемости определяется как наименьшее время, для которого
выживаемость меньше 0,5.
Чтобы определить медиану выживаемости, нужно постро-
ить кривую выживаемости и посмотреть, где она впервые
опускается ниже 0,5. Например, на рис. 11.3 это произошло в 8
часов. Аналогично медиане могут быть вычислены другие про-
центили выживаемости.
Если число умерших меньше половины числа наблюдаемых,
медиану определить невозможно.
382
ГЛАВА 11
Рис. 11.3. Эта кривая выживаемости плутониан после начала пассивного курения рас-
считана по данным с табл. 11.1; ход вычислений показан в табл. 11.2. Кривая представ-
ляет собой ступенчатую линию, каждой ступеньке соответствует момент смерти одно-
го или нескольких плутониан.
Стандартная ошибка и доверительные интервалы
выживаемости
Как всегда при исследовании выборки, полученная нами кри-
вая выживаемости на самом деле представляет собой оценку
кривой выживаемости. Если бы мы могли определить продол-
жительность жизни всех плутониан, подвергшихся пассивному
курению, мы получили бы гладкую кривую вроде изображен-
ной на рис. 11.2. Оценку точности приближения дает стандарт-
ная ошибка выживаемости; ее можно рассчитать по формуле
Гринвуда*:
d
t
i
s
=
S
(t)
,
S(t)
∑
n
(
n
−
d
)
t
i
t
i
t
i
где сумма берется по всем моментам ti, от нуля до t включитель-
но. На примере данных по выживаемости плутониан после на-
* Вывод этой формулы можно найти в: D. Collett. Modelling survival data in
medical research. Chapman and Hall, London, 1994, pp. 22—26.
АНАЛИЗ ВЫЖИВАЕМОСТИ
383
Рис. 11.4. Кривая выживаемости плутониан после начала пассивного курения и ее 95%
доверительная область (ход вычислений показан в табл. 11.3). Границы доверительной
области показаны пунктиром.
чала пассивного курения рассчитаем стандартную ошибку вы-
живаемости для 7 часов:
1
1
2
s
=
0,600
+
+
=
0,155
S
(
7
)
10
(
10
−1
)
9
(
9
−1
)
8
(
8
−
2
)
В табл. 11.3 приведены значения стандартной ошибки для
вычисленных по табл. 11.1 оценок функции выживаемости.
В гл. 7 было показано, как с помощью стандартной ошибки
вычислить доверительные интервалы для долей. Точно также ее
используют для вычисления доверительного интервала для вы-
живаемости. Напомним, что 100(1 - α)-процентный доверитель-
ный интервал для доли р задается неравенством
p
−
zαs
<
p < p
+
zαs
,
p
p
где zα — двустороннее критическое значение для стандартного
нормального распределения, α — уровень значимости, p — вы-
борочное значение доли,
s
p
— стандартная ошибка для этой до-
ли. Доверительный интервал для выживаемости в момент t опре-
деляется аналогично:
содержание .. 23 24 25 26 ..
|
|
|